Historien bag denne sang går ud på, at den oprindeligt var blevet afsluttet musikalsk, men lyrisk havde Rivers Cuomo kun en entydig sætning, 'say it ain't so', at arbejde med. Så han havde brug for fortælling for at skylle sporet ud. Dette fik ham til at huske en hændelse fra hans gymnasium, som også fik ham til at huske på en tidligere begivenhed, dvs. skilsmissen fra hans forældre.
Den nævnte hændelse var, da han kom hjem en dag og, som sangen indikerer, fandt 'en persons Heine (dvs. Heineken) trænger sammen sin iskasse'. Med andre ord opdagede han en øl i køleskabet. Og grunden til, at dette fik ham til at tænke tilbage på sin fremmede far, er, at hans far grundlæggende forlod familien på grund af at være alkoholiker. Men på dette tidspunkt var hans mor allerede giftet igen. Så ved at se ølen i køleskabet satte de unge floder indtryk af, at hans stedfar snart også ville hoppe.
Dybest set bruger sangeren denne sang til at præsentere to hovedideer. Først kan det siges, at han ønsker at udlufte den følelsesmæssige bagage, han holdt på, fordi hans far forlod. Og i den henseende, mens han lammer ham lidt, ser det ud til, at han faktisk har tilgivet ham. Faktisk under broen bruger Rivers lejligheden til faktisk at lykønske sin far med at være ædru og 'finde Jesus'.
Men mere til det punkt kan dette spor betragtes som Weezers afhandling mod alkoholisme. F.eks. Lader sangeren i den samme bro vide, omend metaforisk, at han er bange for ikke kun sin stedfar at være en beruset som sin far, men også at han selv udvikler de samme tendenser. Men mere generelt angriber bandet selv alkoholforbruget. Nej, dette er ikke et spor, der forkynder hardcore ædruelighed. Det er snarere at frembringe en idé, som hvis du ikke tager tid, kan dit alkoholforbrug ende med at ødelægge dit liv eller det, du elsker.
Geffen Records udgav dette nummer den 13. juli 1993. Det var den tredje single fra bandets debutalbum, som i sig selv har titlen 'Weezer' (også kaldet 'Blue Album').
'The Blue Album' producerede to andre singler, nemlig:
'Say It Ain't So' blev udelukkende skrevet af Weezers egne Rivers Cuomo. Og produktionen blev udført af en musiker ved navn Ric Ocasek, der ud over at gå i gang med en solokarriere tidligere var medlem af The Cars.
Det visuelle til dette spor blev instrueret af den etablerede musik-videofilmograf Sophie Muller. Og det blev faktisk filmet i Weezer-medlem Matt Sharps garage.
'Say It Ain't So' havde ikke rigtig et alt for imponerende diagram, der især toppede som nummer 6 på det canadiske single-chart. Det lykkedes også at bryde top 40 af UK Singles Chart. Det har imidlertid vist sig at være en fan og kritikerfavorit. For eksempel i 2008 Rullende sten placerede den på deres liste over de '100 største guitar sange nogensinde'.